Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm9958Q8C9U4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms