Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrp4bQ8C6J9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nlrp4bQ8C6J9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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