Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ube3dQ8BX13 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ube3dQ8BX13 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ube3dQ8BX13 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ube3dQ8BX13 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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