Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Usp38Q8BW70 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Usp38Q8BW70 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Usp38Q8BW70 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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