Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pggt1bQ8BUY9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pggt1bQ8BUY9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms