Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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