Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms