Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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H2-M10.4Q85ZW8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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