Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Amigo1Q80ZD8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Amigo1Q80ZD8 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms