Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NanogQ80Z64 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms