Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
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Dsg1bQ7TSF1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Dsg1bQ7TSF1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1bQ7TSF1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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