Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Actn1Q7TPR4 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Actn1Q7TPR4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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