Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Vma21Q78T54 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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