Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CtifQ6PEE2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms