Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ecm29Q6PDI5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ecm29Q6PDI5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ecm29Q6PDI5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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