Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Mfsd13aQ6PDE8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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