Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zbtb40Q6PCS8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms