Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smchd1Q6P5D8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Smchd1Q6P5D8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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