Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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NipblQ6KCD5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
NipblQ6KCD5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
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