Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
CltbQ6IRU5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms