Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ParpbpQ6IRT3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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