Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Krt77Q6IFZ6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Krt77Q6IFZ6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Krt77Q6IFZ6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Krt77Q6IFZ6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Krt77Q6IFZ6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Krt77Q6IFZ6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Krt77Q6IFZ6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms