Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kiaa1549Q68FD9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kiaa1549Q68FD9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms