Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Surf4Q64310 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms