Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Hes3Q61657 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms