Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Klf3Q60980 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Klf3Q60980 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms