Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Utp20Q5XG71 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp20Q5XG71 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms