Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Sft2d1Q5SSN7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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