Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TefmQ5SSK3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms