Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Rbm27Q5SFM8 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbm27Q5SFM8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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