Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Shank3Q4ACU6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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