Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
H2al1nQ497L1 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
H2al1nQ497L1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms