Protein–RNA interactions for Protein: Q3V384

Afg1l, AFG1-like ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg1lQ3V384 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Afg1lQ3V384 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Afg1lQ3V384 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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