Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc9Q3V038 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc9Q3V038 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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