Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dnaaf3Q3UYV8 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dnaaf3Q3UYV8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms