Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
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D13Ertd608eQ3UPR8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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D13Ertd608eQ3UPR8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
D13Ertd608eQ3UPR8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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