Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nhlrc4Q3UP44 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nhlrc4Q3UP44 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nhlrc4Q3UP44 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nhlrc4Q3UP44 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Nhlrc4Q3UP44 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nhlrc4Q3UP44 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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