Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Usp30Q3UN04 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Usp30Q3UN04 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms