Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sf3b2Q3UJB0 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms