Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Rnf224Q3UIW8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf224Q3UIW8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms