Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc34Q3UI66 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms