Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Trafd1Q3UDK1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms