Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf180Q3U827 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rnf180Q3U827 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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