Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Q3U6N9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Q3U6N9 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Q3U6N9 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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