Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc9Q3U0M1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms