Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gtf3c3Q3TMP1 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms