Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cwc27Q3TKY6 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms