Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Usp39Q3TIX9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Usp39Q3TIX9 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms