Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Trappc13Q3TIR1 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms