Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms